他のソフトを使用中に、バックグラウンドでバックアップする場合は「優先度」の設定をしてください。
「設定」メニューの「環境設定」で「優先度」タブをクリックし、「BunBackupの優先度を下げる」をチェックしてください。
これで、BunBackupは他のソフトが動作しているときには待機し、パソコンが空き状態になったときに動作するようになります。

Windows Vista/7/8/10は、ファイルのアクセスにも優先度が有効になりますので、他のOSよりも負荷が少なくなります。